Altan Eker Batı Trakya İskeçe'den göç etmiş bir ailenin çocuğu olarak 1942 yılında Bursa'da doğdu. Bursa Erkek Lisesini bitirdikten sonra, Ankara Siyasal Bilgiler Fakültesi Maliye ve İktisat bölümünden 1965 yılında mezun oldu. 1 sene İngiltere'de Lisan kurslarına devam etti. Türkiye'ye döndükten sonra 5 sene inşaat müteahhitliği yaptı. 1973 yılında Aygen EKER ile evlendi. 2 çocuk babası (Nevra Eker ve Ahmet Eker).
1977 yılında satın aldğı Eker Çiftliğinde yoğurt ve ayran imalatına başladı. 1981 yılında Türkiye'de dönemin en modern tesislerinden biri olan Eker fabrikasını kurarak süt ürünleri sektöründe faaliyete başladı. 15 yıl boyunca Eker Süt Ürünlerinde Yönetim Kurulu Başkanlığı ve Genel Müdürlük yaptı.
1982–1983 yılları arasında Bursa Rotary Kulübü’nde dönem başkanlığı yaptı. Bu dönemde Gemlik, Çanakkale, Bandırma olmak üzere üç yeni kulübün kuruculuğunu yaptı. Hobileri arasında balıkçılık, denizcilik, yelken ve kayak yer alıyordu.
1996 yılında geçirdiği beyin kanaması sonucu vefat etti.
